Das 1.
733 Quadratkilometer große Meeresschutzgebiet des Komodo-Nationalparks wurde 1980 gegründet, um die größte lebende Eidechse der Welt zu schützen, doch unter der Wasseroberfläche liegt ein ebenso prähistorisches Spektakel: Korallenwände, die 40 Meter in die Sape-Straße abfallen, patrouilliert von Mantarochen mit fünf Meter Spannweite und grünen Meeresschildkröten, die durch Strömungen navigieren, die seit dem Miozän unverändert sind. Die Eintrittsgebühr für den Meerespark von 250.000 Indonesischen Rupiah pro ausländischem Besucher finanziert Ranger-Patrouillen auf 29 Vulkaninseln, die jeweils von Thermoklinen umgeben sind, wo kalte Auftriebsgebiete aus dem Indischen Ozean auf warme Strömungen der Floressee treffen und Nährstofffahnen bilden, die über 1.000 Fischarten und 260 riffbildende Korallen ernähren.
Labuan Bajo verwandelte sich von einem Fischerdorf mit 300 Einwohnern im Jahr 1990 zum Tor für Schnorchel-Tagesausflüge ab Labuan Bajo. Sein geschützter Hafen beherbergt heute traditionelle Phinisi-Schoner neben Glasfaser-Schnellbooten, die die Überfahrtszeit zur Insel Komodo von vier Stunden auf 90 Minuten verkürzen. Die Lage der Stadt an der Westspitze von Flores platziert sie 450 Kilometer östlich von Bali, erreichbar über tägliche Flüge zum Flughafen Komodo, der 2015 eröffnet wurde. Der Parkbetrieb läuft täglich von 06:00 bis 18:00 Uhr, wobei morgendliche Abfahrten empfohlen werden, um die Tauchplätze vor dem Höhepunkt der Äquatorsonne um 13:00 Uhr zu erreichen, wenn die Wassertemperaturen von 26 °C auf 29 °C steigen und die Sichtweite aufgrund von Planktonblüten von 25 auf 15 Meter sinkt.
Der Pink Beach an der Ostküste der Insel Komodo verdankt seinen Namen Foraminiferen – mikroskopisch kleinen roten Organismen, deren Kalziumkarbonat-Skelette an Land gespült werden und sich mit weißem Korallensand vermischen, wodurch ein Farbverlauf entsteht, der nur an der Gezeitenlinie sichtbar ist. Manta Point vor Karang Makassar beherbergt das ganze Jahr über Ansammlungen von Riffmantas, die drei untergetauchte Reinigungsstationen umkreisen und bewegungslos schweben, während Putzerlippfische Parasiten entfernen. Die dreibuchtige Formation der Insel Padar, die durch tektonische Hebung entlang des Sunda-Banda-Bogens entstanden ist, bietet Schnorchelmöglichkeiten über Seegraswiesen, wo Karettschildkröten in fünf Metern Tiefe grasen. Diese Orte bilden den Kern der meisten Komodo-Schnorcheltouren, die unter Genehmigungen des Balai Taman Nasional Komodo operieren, welche tägliche Bootsankünfte begrenzen, um die 2018 installierten Ankerbojen zu schonen und Ankerschäden zu verhindern.
Die Auszeichnung des Parks als UNESCO-Weltnaturerbe im Jahr 1991 würdigte sowohl die terrestrische als auch die marine Biodiversität, aber die Durchsetzung bleibt ungleichmäßig: Illegale Fischerei besteht in den äußeren Zonen fort, während Kerngebiete wie Batu Bolong eine Riffgesundheit bewahren, die mit Raja Ampat vergleichbar ist. Die Wasserbedingungen variieren stark je nach Jahreszeit – von Mai bis September bringen Südost-Passatwinde das Oberflächenwasser in Bewegung, liefern aber das Plankton, das pelagische Arten anlockt, während von Oktober bis April ruhigere See und 30 Meter Sichtweite herrschen, die sich für Unterwasserfotografie eignen.
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